Bank Gen Pertanian yang berlokasi di BSIP Biogen merupakan Bank Gen Nasional untuk mendukung kegiatan pengelolaan sumber daya genetik (SDG) pertanian di bawah koordinasi Kementerian Pertanian. Dalam kapasitasnya sebagai Bank Gen Nasional, Bank Gen Pertanian lebih memprioritaskan untuk melakukan pengelolaan koleksi dasar (base collection), di samping juga koleksi aktif (active collection) SDG pertanian untuk mendukung kegiatan penelitian.